La première visite d'Edgar Aubert de la Rüe dans les îles Kerguelen date du 12 novembre 1928 au 25 février 1929, où, en compagnie de sa femme, il a séjourné à Port-Couvreux et à Port-Jeanne d'Arc et exploré les côtes et les îles à bord de navires baleiniers. Du 24 janvier à la fin de mars 1931, il est chargé de réaliser une mission géologique pour le Ministère des Colonies. De ces deux séjours, sortira en 1932 une thèse qui est une somme de connaissances uniques sur les Kerguelen pour l'époque.

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Edgar Aubert de la Rüe reviendra plus tard aux Kerguelen, du 11 décembre 1949 au 16 janvier 1950 et du 12 décembre 1951 jusqu'en janvier 1953, comme géologue et conseiller scientifique. Il assistera aux premières années de la base actuelle.